Exigences d'échantillon
Quantité minimale, concentration, RIN et pureté pour le RNA-seq bulk, les workflows faible quantité et le séquençage d'ARN exosomal. Y compris ce que nous acceptons en matériel dégradé et FFPE, où le seuil de RIN habituel ne s'applique pas.
Plateforme NGS & Biologie moléculaire
L'ARN peut être soumis dans de l'eau sans RNase, un réactif de stabilisation de l'ARN, ou du Tris 10mM pH 8,0. L'ARN total doit être exempt d'ADN, avec un OD260/280 ≥ 1,8, OD260/230 ≥ 1,8 et un RIN ≥ 6. Expédier sur glace carbonique. Ces exigences s'appliquent à notre plateforme NGS & Biologie moléculaire (RNA-seq en masse et validation RT-qPCR).
| Service | Type d'échantillon | Quantité recommandée | Quantité minimale | Concentration minimale |
|---|---|---|---|---|
| Séquençage du transcriptome entier / ARNlnc | ARN total | ≥ 3 µg | 1 µg | 20 ng/µL |
| Séquençage ARN faible quantité | ARN total | ≥ 20 ng | 1 ng | 50 pg/µL |
| Séquençage ARNm | ARN total | ≥ 500 ng | 200 ng | 20 ng/µL |
| Cellules | ≥ 1×10⁶ | — | — | |
| Tissu | ≥ 50 mg | 10 mg | — | |
| Métatranscriptome | ARN total | ≥ 4 µg | 3 µg | 50 ng/µL |
| Cellules | ≥ 5×10⁶ | — | — | |
| Échantillons environnementaux | ≥ 1,5 g | — | — | |
| Séquençage ARN exosomal | ARN total | ≥ 100 ng | — | 20 ng/µL |
| Surnageants cellulaires | ≥ 15 mL | — | — | |
| Sérum, plasma | ≥ 1 mL | — | — |
Le Séquençage ARN exosomal ci-dessus couvre l'analyse du cargo sur notre plateforme Exosomes & VE. L'isolement et la caractérisation des VE (NTA, Western blot) utilisent les mêmes volumes de biofluide de départ. Confirmez le volume exact avec nous si vous avez besoin d'un isolement seul, sans RNA-seq.
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