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Immuno-oncologie

OMICS4 réalise le profilage multi-omics derrière les études du microenvironnement tumoral : RNA-seq bulk et cellule unique, quantification ciblée et, via notre partenariat avec MIPP, des panels protéiques plasmatiques conçus pour l'immuno-oncologie.

Aperçu

Compartiments tumoral et immunitaire, séquencés

OMICS4 réalise le travail de laboratoire derrière les études d'immuno-oncologie. Les compartiments tumoral et immunitaire sont extraits, séquencés et contrôlés dans nos propres laboratoires, et restitués en données primaires que votre équipe peut analyser elle-même ou confier à GenXMap.

Plateaux

Les plateaux mobilisés par une étude IO

Extraction & contrôle qualité

ARN et ADN extraits de matériel tumoral difficile.

  • Blocs et lames FFPE
  • Tissu congelé, PBMC, sang total
  • Intégrité et pureté documentées sur chaque échantillon
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NGS & Biologie moléculaire

Séquençage et quantification ciblée sur le même matériel.

  • RNA-seq bulk sur une cohorte
  • RNA-seq cellule unique pour les compartiments tumoral et immunitaire
  • Exome entier et panels ciblés sur l'ADN tumoral
  • qPCR et dPCR pour la confirmation des marqueurs candidats
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Protéomique

Mesure protéique plasmatique en complément des couches de séquençage.

  • Panels immuno-oncologie ciblés par test d'extension de proximité, avec MIPP
  • LC-MS/MS pour le profilage non ciblé
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Les échantillons acceptés

Blocs et lames FFPE, tissu tumoral congelé, biopsies, PBMC, sang total, plasma et suspensions cellulaires. Les quantités minimales, seuils de RIN et critères de qualité de l'ADN sont publiés par type d'échantillon. Le matériel d'archive et à faible entrée est traité couramment : si votre matériel passe sous les seuils publiés, signalez-le dans la demande de devis et nous vous dirons ce qui est faisable avant tout envoi.

Ce que vous recevez

Un rapport QC pour chaque échantillon. Des fichiers FASTQ démultiplexés avec les métriques QC au niveau de la course pour les services de séquençage. Des tableaux de résultats pour la PCR et le travail protéique.

Où s'arrête la paillasse

L'alignement, la quantification, l'intégration, la découverte de biomarqueurs et la modélisation ne font pas partie d'une réservation de plateau. Elles sont assurées par l'équipe R&D de GenXMap, sous la forme du Immune Response Signature Package, un programme conçu pour votre industrie plutôt qu'une ligne de devis. Demandez-le dans la demande de devis, les deux sont cadrés ensemble.

Immune Response Signature Package chez GenXMap

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Dites-nous le type d'échantillon, le nombre et le calendrier.

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