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Maladies Infectieuses & Microbiome

Les plateformes OMICS4 combinent transcriptomique hôte et profilage du microbiome pour aider les chercheurs à comprendre les interactions hôte-pathogène et la dynamique des communautés microbiennes, réservables et prêtes pour l'audit à chaque étape.

Aperçu

Transcriptomique hôte et microbiome, sur une même plateforme

OMICS4 combine transcriptomique hôte et profilage du microbiome pour aider les chercheurs à comprendre les interactions hôte-pathogène et la dynamique des communautés microbiennes dans les contextes de maladies infectieuses, avec la couche Computational Biology & AI de GenXMap disponible en option pour la découverte de biomarqueurs et l'interprétation intégrée. Notre plateforme métagénomique & microbiome s'appuie notamment sur notre partenariat avec l'IHU Méditerranée Infection.

Capacités OMICS4

Quatre capacités clés pour la recherche en maladies infectieuses

Transcriptomique des interactions hôte-pathogène

Dynamique transcriptionnelle de l'hôte et du pathogène sur la cinétique d'infection.

  • Dual RNA-seq (hôte + pathogène) le cas échéant
  • Profilage transcriptionnel en cinétique d'infection
  • Caractérisation de la signature de réponse immunitaire de l'hôte
Voir la plateforme associée

Profilage des communautés du microbiome (16S / métagénomique)

Composition et fonction des communautés suivies dans le temps.

  • Séquençage 16S rRNA et métagénomique shotgun
  • Analyse de diversité, composition & voies fonctionnelles
  • Suivi longitudinal des variations du microbiome
Voir la plateforme associée

Découverte de biomarqueurs de réponse à l'infection

Un service de la couche Computational Biology & AI de GenXMap, construit par-dessus les plateformes OMICS4.

  • Biomarqueurs hôtes candidats de sévérité/réponse
  • Validation inter-cohortes des signatures d'infection
  • Intégration avec les métadonnées cliniques/épidémiologiques
Nous consulter

Bioinformatique intégrée & interprétation par IA

Un service de la couche Computational Biology & AI de GenXMap, construit par-dessus les plateformes OMICS4.

  • Modèles de données combinées hôte + microbiome
  • Pipelines reproductibles pour études d'épidémie ou de cohorte
  • Rapports adaptés aux contextes de recherche ou de santé publique
Nous consulter
Étude de cas Les études de cas pour ce secteur sont en préparation : écrivez-nous à contact@omics4.com pour discuter d'un projet directement.

Adaptation

Comment OMICS4 s'adapte à votre process

Aucun programme ne suit exactement le même flux de travail. Voici comment OMICS4 s'intègre à ce que vous avez déjà en place.

Leur réalité

Les échantillons peuvent être sensibles sur le plan biosécurité (pathogènes BSL-2/3) et nécessitent des chaînes de manipulation spécifiques.

Comment OMICS4 s'adapte

La logistique des échantillons et la manipulation en laboratoire sont cadrées selon vos exigences de biosécurité et de confinement dès la réception.

Leur réalité

Les études combinent souvent des échantillons hospitaliers, de terrain et de laboratoire, de qualité variable.

Comment OMICS4 s'adapte

Les seuils de contrôle qualité et nos protocoles sont adaptés par source d'échantillon plutôt que d'appliquer un standard unique.

Leur réalité

Les résultats doivent se relier aux données épidémiologiques ou de sévérité clinique, pas seulement au signal moléculaire.

Comment OMICS4 s'adapte

Les résultats moléculaires sont livrés aux côtés de vos métadonnées cliniques/épidémiologiques pour une interprétation directe.

Leur réalité

Certains programmes — santé publique, réponse aux épidémies — fonctionnent sur des délais compressés.

Comment OMICS4 s'adapte

Le délai de traitement est calibré selon l'urgence du programme, du rythme R&D standard aux fenêtres de réponse rapide.

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Parlons de votre échantillon, de votre question, de votre calendrier.

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