Maladies Infectieuses & Microbiome

Aperçu

L'hôte et la communauté, depuis une seule collecte

OMICS4 réalise le séquençage derrière les études en maladies infectieuses : transcriptome de l'hôte, 16S et métagénomique shotgun, à partir de matrices où une extraction standard sous-performe. La biosécurité et le confinement sont cadrés à la réception, pas une fois les échantillons arrivés.

Plateaux

Les plateaux mobilisés par une étude en maladies infectieuses

Les échantillons acceptés

Écouvillons, selles, biopsies, sang, isolats, biofilms et échantillons environnementaux. Ce sont les matrices où une extraction standard sous-performe, donc le protocole est choisi par matrice plutôt qu'appliqué comme un standard unique. Les protocoles de collecte sont publiés par type d'échantillon, et les critères ADN s'appliquent après extraction.

Biosécurité et confinement

La logistique des échantillons et leur manipulation au laboratoire sont cadrées sur vos exigences de biosécurité et de confinement dès la réception, avant tout envoi. Une partie de nos laboratoires se trouve au bâtiment Méditerranée Infection à Marseille, l'un des principaux instituts européens de recherche en maladies infectieuses.

Ce que vous recevez

Un rapport QC pour chaque échantillon. Des FASTQ démultiplexés avec les métriques QC au niveau de la course pour les services de séquençage. Des tableaux de résultats pour la PCR. Des délais publiés par service.

Où s'arrête la paillasse

L'alignement, la quantification, l'intégration, la découverte de biomarqueurs et la modélisation ne font pas partie d'une réservation de plateau. Elles sont assurées par l'équipe R&D de GenXMap, sous la forme du Host–Microbiome Response Package — un programme conçu pour votre industrie, pas une ligne de devis. Demandez-le dans la demande de devis, les deux sont cadrés ensemble.